“Bis April 1946 untersuchte das dazu eingesetzte angloamerikanische Komitee die Lage von hunderttausenden Holocaustüberlebenden, die unter äußerst schweren Umständen als Displaced Persons in europäischen Lagern gefangen waren, und hörte auch Vertreter der Araber an. Diese lobten den gesuchten Kriegsverbrecher al-Husseini einhellig als ihren einzigen Führer, lehnten jede weitere Aufnahme von Juden in Palästina strikt ab und drohten ihnen und den Briten mit Gewalt. Dagegen verwies Richard Crossman als Vertreter Großbritanniens auf die SS-Mitgliedschaft des Mufti und seine Mitwirkung am deutschen Vernichtungskrieg.[119] Im Mai 1947 setzte die UNO den UNSCOP-Ausschuss ein, der alle relevanten Organisationen zum Palästinaproblem befragte. Das AHC lehnte den Ausschuss und alle Gespräche mit ihm ab, weil die „natürlichen Rechte“ der Araber in Palästina „selbstverständlich“ und gemäß der Charta der Vereinten Nationen nicht zu untersuchen, sondern anzuerkennen seien. Diese Haltung trug indirekt dazu bei, dass sich der UN-Teilungsplan für Palästina durchsetzte.[120]
Al-Husseini beauftragte, wie damals allgemein vermutet wurde, die Ermordung von Sami Taha,[121] dem Leiter der Gewerkschaft Palestine Arab Workers Society, vor dessen Haus in Haifa am 12. September 1947.[121]
Am 27. November 1947, zwei Tage vor dem Teilungsbeschluss der UNO, suchte al-Husseini ein einziges Mal Kontakt mit der Jewish Agency und schlug ihr Geheimgespräche ohne Vermittlung arabischer Länder vor. David Ben-Gurion antwortete, man sei bereit, mit allen arabischen Führern außer dem Mufti zu verhandeln. Ohne es öffentlich zuzugeben, waren einige arabische Führer kompromissbereit, darunter der Nashashibi-Clan und dessen Verbündete in Hebron, Nablus und Nazareth. Daraufhin ließ der Husseini-Clan mehrere dieser Gegner nach Art der Mafia ermorden.[122] Als AHC-Führer sorgte der Mufti dafür, dass die arabischen Staaten den UN-Teilungsplan kompromisslos ablehnten. Palästinenser, die mit Juden und der UNO darüber verhandeln wollten, konnten sich nicht gegen ihn durchsetzen. Viele ließ er ermorden, darunter seinen Cousin Fawzi Darwish Husseini.[123]
Nach dem UN-Teilungsbeschluss führte der Mufti eine Truppe aus Muslimbrüdern in den Kampf gegen jüdische Zionisten nach Palästina. Er verhalf hunderten deutschen Kriegsgefangenen zur Flucht aus britischen Lagern und vereinte seine Truppe mit ihnen sowie mehr als 900 muslimischen Bosniern, die schon in seiner SS-Division Handschar gekämpft hatten, mit islamistischen Privattruppen ägyptischer Großgrundbesitzer, Anhängern des Generals Francisco Franco und Kämpfern der Ustascha Kroatiens. Sie verübten Überfälle und Terroranschläge auf jüdische Dörfer. Im Januar 1948 erklärte Golda Meir, die damals die Jewish Agency leitete: „Die Juden in Palästina werden niemals vor dem Mufti von Jerusalem die weiße Flagge hissen.“[124]”